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BioPerl
| Lançamento | 11 de junho de 2002 |
| Versão estável | 1.6.923 (19 de dezembro de 2013) |
| Escrito em | Perl |
| Sistema operacional | Macintosh, Windows, Unix-like |
| Gênero(s) | Bioinformática |
| Licença | Licença artística (software) e GPL |
| Página oficial | bioperl.org |
BioPerl[1] é uma coleção de módulos Perl que facilitam o desenvolvimentode scripts Perl para aplcações de bioinformática. Ele desempenhou um papel integral no Projeto Genoma Humano.[2] O projeto fornece kits de ferramentas com múltiplas funções que tornam mais fácil a criação de análises ou pipelines customizados.[3]
É um projeto de software ativo de código aberto apoiado pela Open Bioinformatics Foundation.
Sua história pode ser traçada desde uma lista de discussão em setembro 1996 discussion. A primeira versão estável foi lançada em 11 de Junho de 2002; a versão estável mais recente (em termos de API) é a release 1.6.1 de outubro de 2009. Há também versões de desenvolvedores produzidas periodicamente. A versão 1.6.0 é considerada a mais estável versão (em termos de bugs) de BioPerl e é recomendada para uso diário, mas a versão "nightly builds" também é extremamente estável, e muitos usuários BioPerl ficam atualmente com esta.
A fim de tirar vantagem do BioPerl, o usuário precisa de um entendimento básico da linguagem de programação Perl, incluindo uma compreensão de como usar referências Perl, módulos, objetos e métodos.
- ↑ Stajich J, Block D, Boulez K, Brenner S, Chervitz S, Dagdigian C, Fuellen G, Gilbert J, Korf I, Lapp H, Lehväslaiho H, Matsalla C, Mungall C, Osborne B, Pocock M, Schattner P, Senger M, Stein L, Stupka E, Wilkinson M, Birney E (2002). «The Bioperl Toolkit: Perl Modules for the Life Sciences». Genome Res. 12 (10). p. 1611–8. PMC 187536
. PMID 12368254. doi:10.1101/gr.361602
- ↑ Lincoln Stein (1996). «How Perl saved the human genome project». The Perl Journal. 1 (2)
- ↑ Mangalam, Harry (setembro de 2002). «The Bio* toolkits--a brief overview». Brief Bioinform. 3 (3). p. 296-302. ISSN 1467-5463. PMID 12230038. doi:10.1093/bib/3.3.296
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