Ein Strukturmotiv bezeichnet in der Biochemie einen Satz von zwei oder mehr Sekundärstrukturen in Biopolymeren mit funktioneller Bedeutung oder ein Teil einer Proteindomäne.[1][2] Strukturmotive in Proteinen sind meistens konserviert und weisen auf eine teilweise funktionelle Ähnlichkeit der Proteine mit dem gleichen Strukturmotiv hin.[3]
Beispiele für Strukturmotive in Proteinen sind die Omega-Schleife, der Zinkfinger, das Helix-Turn-Helix-Motiv, das CSK4-Motiv, das Nest-Motiv und das Nischen-Motiv.