UPGMA

UPGMA (unweighted pair group method with arithmetic mean; česky metoda neváženého párování s aritmetickým průměrem) je jednoduchá aglomerativní hierarchická shluková metoda (jde o tzv. bottom-up metodu, kdy se nejprve shlukují páry sobě nejpodobnější, které se následně shlukují až do konečné sítě). Metodu představili Sokal a Michener.[1]

Termín nevážená metoda nesouvisí s matematickým výpočtem, ale odkazuje na skutečnost, že všechny distance se podílejí stejnou měrou na výpočtu každého průměru. Metoda UPGMA má i alternativu váženého párování, která se nazývá WPGMA. WPGMA generuje výsledky na základně jednoduchého průměru vzdáleností (neboli distancí), zatímco u nevážené metody UPGMA se používá k výpočtu proporcionální průměr (viz pracovní příklad).[2]

  1. Sokal, Michener. A statistical method for evaluating systematic relationships. University of Kansas Science Bulletin. 1958, s. 1409–1438. Dostupné online. 
  2. GARCIA S., PUIGBÒ P. "DendroUPGMA: A dendrogram construction utility" [online]. Dostupné online. [nedostupný zdroj]

UPGMA

Dodaje.pl - Ogłoszenia lokalne