Unter dem Begriff Assemblierung versteht man den Zusammenbau verschiedener Komponenten.
Vorwiegend wird dieser Begriff in der Kerntechnik, der Molekularbiologie, der Elektronik, der Nanotechnik (Nanoassemblierung) oder für Computer verwendet.
In der Virologie bedeutet der Begriff den Zusammenbau der einzelnen Bestandteile (Proteine und Nukleinsäuren) zu einem fertigen Viruspartikel (Virion) in der Wirtszelle.
Bei der DNA-Sequenzierung und der RNA-Sequenzierung, insbesondere in der Metagenomik, versteht man unter Assemblierung (englisch Assembly) die Zusammensetzung eines größeren Contigs aus einzeln sequenzierten, sich überlappenden Nukleinsäuresequenzen (in silico, d. h. am Computer). Nach Möglichkeit versucht man, das ganze Genom, Genomsegment, Plasmid etc. zusammenzusetzen (assemblieren); siehe metagenome-assembled genome.