Epigenetischer Code ist ein Begriff aus dem Wissenschaftsgebiet Epigenetik. Als epigenetische Codes werden hypothetische oder tatsächliche Abbildungsvorschriften (Codes) bezeichnet, die die Regeln für epigenetische Vorgänge beschreiben sollen. Aufgrund des gegenwärtigen Wissensstandes muss die Existenz eines epigenetischen Codes im Sinne eines allgemein definierten, einheitlichen Regelwerks noch als Hypothese angesehen werden (siehe auch Histon-Code-Hypothese).