Formato FASTQ

El formato FASTQ es un formato de archivo basado en texto para almacenar una secuencia biológica de nucleótidos y sus puntajes de calidad correspondientes. Cada nucleótido de la secuencia tiene una puntuación asignada, representada con un único carácter del código ASCII.

Se desarrolló originalmente en el Wellcome Trust Sanger Institute para agrupar una secuencia de formato FASTA y sus datos de calidad provenientes de la secuenciación. Sin embargo, se ha convertido en el estándar de facto para almacenar los resultados de instrumentos de secuenciación de alto rendimiento, como el secuenciador de la compañía Illumina.^[1]​

1. ↑ Cock, P. J. A.; Fields, C. J.; Goto, N.; Heuer, M. L.; Rice, P. M. (2009). «The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants». Nucleic Acids Research 38 (6): 1767-1771. PMC 2847217. PMID 20015970. doi:10.1093/nar/gkp1137.