La molécule d'ammoniac est acheminée entre les deux domaines de la sous-unité α à travers un conduit large de 32Å. La sous-unité β stabilise cette fonction et son absence peut conduire à la production d'ammonium NH4+ à la place d'ammoniac.
↑(en) Magali Cottevieille, Eric Larquet, Slavica Jonic, Maxim V. Petoukhov, Gianluca Caprini, Stefano Paravisi, Dmitri I. Svergun, Maria A. Vanoni et Nicolas Boisset, « The Subnanometer Resolution Structure of the Glutamate Synthase 1.2-MDa Hexamer by Cryoelectron Microscopy and Its Oligomerization Behavior in Solution — Functional Implications », Journal of Biological Chemistry, vol. 283, no 13, , p. 8237-8249 (PMID18199747, DOI10.1074/jbc.M708529200, lire en ligne)
↑(en) Stephen J. Temple, Carroll P. Vance et J. Stephen Gantt, « Glutamate synthase and nitrogen assimilation », Trends in Plant Science, vol. 3, no 2, , p. 51-56 (lire en ligne)DOI10.1016/S1360-1385(97)01159-X
↑(en) Maria Antonietta Vanoni et Bruno Curti, « Structure–function studies of glutamate synthases: A class of self-regulated iron-sulfur flavoenzymes essential for nitrogen assimilation », IUBMB Life, vol. 60, no 5, , p. 287-300 (lire en ligne)DOI10.1002/iub.52 ; PMID18421771