Bendera Guinea Khatulistiwa disetujui tanggal 21 Agustus 1979.
Bendera ini adalah tiga warna melintang, dengan garis hijau, putih dan merah dan segitiga biru pada bagian kiri.
Di tengah bendera, pada garis putih, terdapat lambang Guinea Khatulistiwa, dengan pohon Kapas Sutra, enam bintang kuning dan motto: Unidad Paz Justicia - Persatuan, Perdamaian, Keadilan.