Kementerian Pertahanan Mesir (bahasa Arab: وزارة الدفاع مصر Wuzarah ad-Difa' Mashr) (dahulu bernama Kementerian Jihad atau Kementerian Perang) adalah kementerian dalam Pemerintah Mesir yang membidangi urusan pertahanan. Kementerian Pertahanan dipimpin oleh seorang Menteri Pertahanan (Menhan) yang sejak 27 Maret 2014 dijabat oleh Shidqi Subhi. Kementerian ini mengatur, mengelola, memfasilitasi, mengembangkan dan memelihara urusan Angkatan Bersenjata Mesir. Kementerian ini juga menangani perguruan tinggi militer, perekrutan militer, mobilisasi dan manajemen veteran, serta menangani pabrik-pabrik alat senjata di Mesir. Awalnya, kementerian ini bernama Kementerian Jihad, dan diganti menjadi Kementerian Perang sampai tahun 1980, dan akhirnya diubah menjadi Kementerian Pertahanan sampai sekarang ini.