Nakhoda (disebut [na.k(h)o.da], pinjaman Parsi: ناخدا, rumi: nâkhodâ[1], kata majmuk ناو nâv “kapal, perahu” dan خدا khodâ, “pemimpin, tuan, ketua/kepala”) atau juragan merupakan kelulusan tertinggi untuk seorang pelaut yang berperanan mengawal dan mengemudi sesebuah kapal. Istilah kapten turut digunakan bagi seorang nakhoda yang pernah mengawal sebuah kapal.
Nakhoda mestilah mahir dalam ilmu pelayaran terutama tentang penggunaan peta dan kompas serta sistem bintang di langit. Mereka juga mestilah mengetahui arah laluan terbaik untuk belayar dan mengetahui kedudukan batu karang, terumbu karang, arus dan olak laut berpusing. Angin monsun mestilah diketahui bagi mengelak ribut taufan serta mengelak kapal terlanggar batu karang yang boleh merosakkan kapal.