Een basenpaar (bp) is een dubbelstrengs nucleïnezuur dat bestaat uit twee nucleobasen die door waterstofbruggen met elkaar verbonden zijn en zo de bouwstenen van de dubbele helix van DNA. Het nucleïnezuur is opgebouwd uit nucleotiden.
Een basenpaar (1 bp) geeft 2 bit aan informatie, aangezien er bij DNA of RNA vier verschillende mogelijkheden (nucleotiden) zijn. De massa van een basenpaar in een dubbele DNA-helix bedraagt 650 atomaire massa-eenheden. Het molecuulgewicht van een mol van een bepaalde DNA-soort is dus ongeveer 650 g per basenpaar.