Safra ağacı ya da safra sistemi, karaciğeri, safra kesesini ve safra yollarını kapsayan bir sistemdir. Safra, su, elektrolitler, safra asitleri, kolesterol, fosfolipitler ve konjuge bilirubinden oluşur. Bu bileşenlerden bazıları hepatositler (karaciğer hücreleri) tarafından sentezlenir, geri kalanlar ise kan yolu ile karaciğere alınır.
Safra, karaciğer tarafından ortak hepatik kanalı oluşturmak üzere birleşecek küçük kanalcıklara salgılanır. Yemekler arasında salgılanan safra, safra kesesinde saklanır. Yemek sırasında ise kesede depolanmış safra, yağların sindirimine yardımcı olmak için safra duodenuma bırakılır.
Safra ağacı içindeki basınç safra kesesi taşlarına ve karaciğer sirozuna neden olabilir. Safra sisteminin tıkanması ayrıca cildin ve göz akının sararması ile ilişkili sarılığın oluşması ile sonuçlanabilir.[2]