KRAS

KRAS
Dostupne strukture PDB Pretraga ortologa: PDBe RCSB Spisak PDB ID kodova 4WA7, 1D8D, 1D8E, 3GFT, 4DSN, 4DSO, 4EPR, 4EPT, 4EPV, 4EPW, 4EPX, 4EPY, 4L8G, 4LDJ, 4LPK, 4LRW, 4LUC, 4LV6, 4LYF, 4LYH, 4LYJ, 4M1O, 4M1S, 4M1T, 4M1W, 4M1Y, 4M21, 4M22, 4NMM, 4OBE, 4PZY, 4PZZ, 4Q01, 4Q02, 4Q03, 4QL3, 4TQ9, 4TQA, 4DST, 4DSU, 5F2E,%%s2MSC, 2MSD, 2MSE
Identifikatori
Aliasi	KRAS
Vanjski ID-jevi	OMIM: 190070 MGI: 96680 HomoloGene: 37990 GeneCards: KRAS
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 12 (čovjek)[1] Bend 12p12.1 Početak 25,205,246 bp[1] Kraj 25,250,936 bp[1]
Lokacija gena (miš) Hrom. Hromosom 6 (miš)[2] Bend 6 G3|6 77.37 cM Početak 145,162,425 bp[2] Kraj 145,195,965 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena Molekularna funkcija • nucleotide binding • LRR domain binding • GDP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GTP binding • GMP binding • GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine • GO:0006184 GTPase activity • vezivanje identičnih proteina Ćelijska komponenta • citoplazma • citosol • membrana • focal adhesion • extrinsic component of cytoplasmic side of plasma membrane • ćelijska membrana • mitohondrija • Lipidni splav Biološki proces • visual learning • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • response to mineralocorticoid • positive regulation of protein phosphorylation • regulation of long-term neuronal synaptic plasticity • regulation of protein stability • epidermal growth factor receptor signaling pathway • positive regulation of MAP kinase activity • cytokine-mediated signaling pathway • negative regulation of cell differentiation • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • response to glucocorticoid • MAPK cascade • axon guidance • Fc-epsilon receptor signaling pathway • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • forebrain astrocyte development • endocrine signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • homeostasis of number of cells within a tissue • striated muscle cell differentiation • Ras protein signal transduction • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis • regulation of synaptic transmission, GABAergic • actin cytoskeleton organization • leukocyte migration • GO:0072468 Transdukcija signala • positive regulation of Rac protein signal transduction • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of cell population proliferation • ERBB2 signaling pathway • liver development • positive regulation of cellular senescence • female pregnancy • response to isolation stress Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	3845	16653
Ensembl	ENSG00000133703	ENSMUSG00000030265
UniProt	P01116	P32883
RefSeq (mRNK)	NM_004985 NM_033360 NM_001369786 NM_001369787	NM_021284
RefSeq (bjelančevina)	NP_004976 NP_203524 NP_001356715 NP_001356716 NP_004976.2	NP_067259 NP_001390169 NP_001390170 NP_001390171 NP_001390172 NP_001390173 NP_001390174 NP_001390175
Lokacija (UCSC)	Chr 12: 25.21 – 25.25 Mb	Chr 6: 145.16 – 145.2 Mb
PubMed pretraga	[3]	[4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek Pogledaj/uredi – miš

KRAS (skr. od eng. Kirsten rat sarcoma virus = Kirstenov virus pacovskog sarkoma) je gen daje upute za stvaranje proteina zvanog K-Ras, koji je dio RAS/MAPK puta. Protein prenosi signale izvan ćelije do ćelijskog jedra. Ovi signali upućuju ćeliju da raste i dijeli se (razmnožava) ili sazrijeva i preuzima specijalizirane funkcije (diferencira). K-Ras protein je GTPaza, što znači da pretvara molekulu koji se naziva GTP u drugu molekulu koji se naziva GDP. Na ovaj način protein K-Ras djeluje kao prekidač koji se uključuje i isključuje pomoću molekula GTP i GDP. Za prijenos signala, mora se uključiti pričvršćivanjem (vezivanjem) za molekulu GTP -a. Protein K-Ras se isključuje (inaktivira) kada pretvara GTP u BDP. Kada je protein vezan za BDP, ne šalje signale u ćelijsko jedro.

Zove se kao eng. skraćenica KRAS jer je prvi put identificiran kao onkogen u Kirstenov pacovski virusni sarkom.^[5] Virusni onkogrn je izvedenica ćelijskog genoma. Prema tome, gen KRAS u ćelijskom genomu zove se protoonkogen.

Genski proizvod je prvi put pronađen kao p21 GTPaza.^[6][7] Kao i drugi članovi potporodice ras, KRAS protein je GTPaza i rani je učesnik na mnogim putevima transdukcije signala. KRAS je obično vezan za ćelijske membrane, zbog prisutnosti izoprenske grupe na svom C-kraju. Postoje dva proteinska produkta gena KRAS u ćelijama sisara koji su rezultat pojave alternativnog egzona 4 (egzona 4A i 4B): K-Ras4A i K-Ras4B; ti proteini imaju različitu strukturu u svom C-terminalnom području i koriste različite mehanizme za lokalizaciju na ćelijske membrane, uključujući plazmamembrane.^[8]

1. ^ ^{a b c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000133703 - Ensembl, maj 2017
2. ^ ^{a b c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030265 - Ensembl, maj 2017
3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. ^ Tsuchida N, Ryder T, Ohtsubo E (1982). "Nucleotide sequence of the oncogene encoding p21 transforming protein of Kirsten murine sarcoma virus". Science. 217 (4563): 937–939. doi:10.1126/science.6287573. PMID 6287573.
6. ^ Scolnick EM, Papageoege AG, Shih TY (1979). "Guanine nucleotide-binding activity for src protein of rat-derived murine sarcoma viruses". Proc Natl Acad Sci USA. 76 (5): 5355–5559. doi:10.1073/pnas.76.10.5355. PMID 228228.
7. ^ Kranenburg O (novembar 2005). "The KRAS oncogene: past, present, and future". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Reviews on Cancer. 1756 (2): 81–2. doi:10.1016/j.bbcan.2005.10.001. PMID 16269215.
8. ^ Welman A, Burger MM, Hagmann J (septembar 2000). "Structure and function of the C-terminal hypervariable region of K-Ras4B in plasma membrane targeting and transformation". Oncogene. 19 (40): 4582–91. doi:10.1038/sj.onc.1203818. PMID 11030147.