Excavata

Jak číst taxoboxExcavata
alternativní popis obrázku chybí
Vědecká klasifikace
DoménaEukaryota
(nezařazeno)„Excavata“
superskupiny
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Excavata (česky exkaváti) byla protistní infraříší, později povýšenou na jednu z šesti základních eukaryotických superskupin[1], uznávanou cca mezi lety 2003 – 2019[2]. Později byla odhalená jako nepřirozené (parafyletické) seskupení několika vývojových linií, které je proto v odborné terminologii uváděné jako „Excavata“ (v uvozovkách) nebo nazývané obecným jménem Excavates[3]; status superskupin převzaly dvě hlavní exkavátní linie – Discoba a Metamonada.[2]

Návrh na seskupení původně samostatných skupin na základě tzv. exkavátní hypotézy byl formulován již na konci 20. století[4], jako taxon (infraříše) byla Excavata formálně vytvořena v roce 2002 Cavalier-Smithem.[5]

Nepřirozenost exkavát vyplynula z moderních hypotéz o kořeni fylogenetického stromu eukaryot. Sám Cavalier-Smith již v r. 2009 přiznával parafyletismus exkavát, když kladl kořen dovnitř krásnooček (v širším smyslu, tj. Euglenozoa)[6]. Přirozenost exkavát je neslučitelná i s většinově uznávanou hypotézou, která kořen klade mezi Opimoda (exkavátní malawimonády společně s Podiata) a Diphoda (exkavátní Discoba a pravděpodobně i metamonády společně s Diaphoretickes, Hemimastigophora a případně Provora, pokud nejsou v Diaphoretickes)[7][2], navrženou již v r. 2014[8].

  1. Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor. The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, roč. 52, čís. 5, s. 399–451. Dostupné v archivu pořízeném dne 2017-09-14.  Archivováno 14. 9. 2017 na Wayback Machine.
  2. a b c Ivan Čepička, Jiří Neustupa, Vladimír Hampl. Protistologie: Excavata, záznam přednášek na internetu [online]. Univerzita Karlova, přírodovědná fakulta: 2024-10-24. Dostupné online. 
  3. Chybná citace: Chyba v tagu <ref>; citaci označené Adl_2019 není určen žádný text
  4. SIMPSON, Alastair G.B.; PATTERSON, David J. The ultrastructure of Carpediemonas membranifera (Eukaryota) with reference to the “excavate hypothesis”. S. 353–370. European Journal of Protistology [online]. 1999-12. Roč. 35, čís. 4, s. 353–370. DOI 10.1016/S0932-4739(99)80044-3. (anglicky) 
  5. CAVALIER-SMITH, Thomas. Protist phylogeny and the high-level classification of Protozoa. S. 338–348. European Journal of Protistology [online]. 2003-01. Roč. 39, čís. 4, s. 338–348. DOI 10.1078/0932-4739-00002. (anglicky) 
  6. CAVALIER-SMITH, Thomas. Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree. S. 342–345. Biology Letters [online]. 2010-06-23. Roč. 6, čís. 3, s. 342–345. DOI 10.1098/rsbl.2009.0948. (anglicky) 
  7. DERELLE, Romain; TORRUELLA, Guifré; KLIMEŠ, Vladimír; BRINKMANN, Henner; KIM, Eunsoo; VLČEK, Čestmír; LANG,, B. Franz, ELIÁŠ, Marek. Bacterial proteins pinpoint a single eukaryotic root. S. E693–E699. Proceedings of the National Academy of Sciences USA (PNAS) [online]. 17. únor 2015. Svazek 112, čís. 7, s. E693–E699. Dostupné online. ISSN 1091-6490. DOI 10.1073/pnas.1420657112. (anglicky) 
  8. HE, Ding; FIZ-PALACIOS, Omar; FU, Cheng-Jie; FEHLING, Johanna; TSAI, Chun-Chieh; BALDAUF, Sandra L. An Alternative Root for the Eukaryote Tree of Life. S. 465–470. Current Biology [online]. 17. únor 2014. Svazek 24, čís. 4, s. 465–470. Dostupné online. ISSN 0960-9822. DOI 10.1016/j.cub.2014.01.036. (anglicky) 

Excavata

Dodaje.pl - Ogłoszenia lokalne