MTV Movie Awards 1999 var 1999-udgaven af MTV Movie Awards sendt på MTV. Dette blev afholdt den 5. juni 1999 i Santa Monica, Californien og showets vært var Lisa Kudrow. Aftenens optrædener var Kid Rock, Robbie Williams og Will Smith sammen med Dru Hill og Kool Mo Dee. Showets højeste antal nomineringer og højst antal vundne priser blev filmen Vild med Mary som vandt 3 ud af 7 nomineringer. Lige bagefter kom filmen Armageddon med i alt 6 nomineringer, hvoraf den vandt 2 priser, bagefter Shakespeare in Love med 1 vunden pris ud af 4 nomineringer og til sidst Dødbringende våben 4 også med 4 nomineringer, dog ingen priser.