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Die Hafen Wien GmbH ist ein Unternehmen der stadteigenen Wien Holding (95 %) sowie der Wirtschaftskammer Wien (5 %), dessen Ursprünge ins Jahr 1962/63 zurückreichen. Durch die im Jahr 1962/1963 erfolgte Gründung der Wiener Hafenbetriebsgesellschaft m.b.H. (WHB) wurden der Winterhafen (Freudenauer Hafen), Alberner Hafen und der Ölhafen Lobau aus dem Wiener Magistratsverband entlassen, in dem sie sich seit Ende des Zweiten Weltkriegs befanden.