De vlag van Muntendam werd op 29 oktober 1929 door de gemeenteraad van Muntendam vastgesteld als gemeentevlag.
De vlag verviel als gemeentevlag toen op 1 januari 1990 Muntendam werd samengevoegd met de dorpen Meeden (gemeente Meeden), Noordbroek en Zuidbroek (gemeente Oosterbroek) tot de gemeente Menterwolde. Deze gemeente is vervolgens op 1 januari 2018 opgegaan in de gemeente Midden-Groningen.