Het wapen van Warffum werd op 12 oktober 1903 per Koninklijk Besluit door de Hoge Raad van Adel aan de Groninger gemeente Warffum toegekend. Vanaf 1990 is het wapen niet langer als gemeentewapen in gebruik omdat de gemeente Warffum opging in de gemeente Hefshuizen, sinds 1992 hernoemd in Eemsmond. In het Wapen van Eemsmond is de Maltezer kruis als verwijzing naar Warffum en Usquert opgenomen.