Back جمول Arabic Jmol Catalan Jmol German Jmol Greek Jmol English Jmol Spanish جیمول FA Jmol French Jmol GL Jmol ID
 |
Niektorý z redaktorov požiadal o revíziu tohto článku. Redaktor si napríklad nie je istý, či neobsahuje obsahové chyby alebo je dostatočne zrozumiteľný. Prosím, opravte a zlepšite tento článok. Po úprave článku môžete túto poznámku odstrániť. |
| Jmol | |
mol_logo_2013.svg){kind=logo} Logo  Trojdimenzionálna štruktúra strepavidínu zobrazená pomocou Jmolu | |
| Základné informácie | |
|---|---|
| Vývojár | tím vývojárov Jmolu |
| Posledná stabilná verzia | 14.31.34, 7. marec 2021 |
| Vyvinutý v | Java JavaScript (JSmol) |
| Operačný systém | Multiplatformový softvér |
| Lokalizácia | angličtina, čeština, čínstina, dánčina, francúzština, holandčina, indonézština, katalánčina, kórejčina, maďarčina, nemčina, portugalčina, španielčina, taliančina, turečtina, ukrajinčina[1] |
| Typ softvéru | molekulové modelovanie |
| Licencia | LGPL 2.0 |
| Ďalšie odkazy | |
| Webová stránka | www.jmol.org |
 Pozri aj Informačný portál | |
Jmol je počítačový softvér na molekulové modelovanie chemických štruktúr v 3 dimenziách.[2] Jmol vykresľuje 3D reprezentáciu molekuly, ktorú možno použiť vo výuke[3] alebo vo výskume, napríklad chemickom alebo biochemickom. Jmol je napísaný v jazyku Java, takže funguje na operačných systémoch Windows, macOS, Linux a Unix, ak je Java nainštalovaná.[3] Je to free and open source softvér vydaný pod lincenciou GNU Lesser General Public License verziou 2.0.[3] Existujú i samostatná aplikácia a software development kit,[3] ktoré možno integrovať do iných aplikácií využívajúcich Javu, napríklad Bioclipse alebo Taverna.[chýba zdroj]
Populárnym spôsobom použitia Jmolu je využitie appletu, ktorý možno vložiť na webové stránky a zobraziť molekuly rôznymi spôsobmi.[4] Jmol podporuje mnoho formátov chemických súborov vrátane Protein Data Bank (.pdb), Crystallographic Information File (.cif), MDL molfile (.mol) a Chemical Markup Language (.cml).[3] Takisto existuje i verzia postavená na JavaScripte (HTML5), JSmol, ktorú možno použiť na počítačoch bez Javy.[5]
Applet Jmolu okrem iného podporuje i použitie ako alternatívu k Chime plug-inu,[3] ktorý už nie je aktívne vyvíjaný. I keď Jmol má mnoho funkcií, ktoré Chime nemá, netvrdí, že by sa snažil reprodukovať všetky funkcie Chimeu a chýba hlavne mód Sculpt (mód na úpravu molekúl, napr. konformácií).[chýba zdroj] Chime vyžadoval inštaláciu v podobe plug-inu a Internet Explorer 6.0 či Firefox 2.0 na Windowse alebo Netscape Communicator 4.8 na Mac OS 9.[chýba zdroj] Jmol vyžaduje inštaláciu Javy a funguje na mnohých platformách.[3] Je funkčný napríklad v Mozille Firefox, Internet Exploreri, Opere, Google Chrome i Safari.[3]
- ↑ Translations : Jmol [online]. Launchpad, 2010-09-14, [cit. 2023-07-28]. Dostupné online. (po anglicky)
- ↑ CHEN, Jim X.; CHEN, Chunyang. Guide to graphics software tools. London : Springer, 2008. (2. ed.) ISBN 978-1-84800-900-4.
- ↑ a b c d e f g h HERRÁEZ, Angel. Biomolecules in the computer: Jmol to the rescue. Biochemistry and Molecular Biology Education, 2006-07, roč. 34, čís. 4, s. 255–261. Dostupné online [cit. 2023-07-28]. DOI: 10.1002/bmb.2006.494034042644. (po anglicky)
- ↑ HERRÁEZ, Angel; HERRÁEZ, Angel. Learning to use Jmol: basic and intermediate levels. Morrisville, NC : Lulu.com, 2007. (1. ed.) ISBN 978-1-84799-259-8.
- ↑ JSmol [online]. [Cit. 2015-11-02]. Dostupné online. Archivované 2018-01-01 z originálu.