Fukoziltransferaza je enzim koji prenosi šećer L-fukozu sa donora GDP-fukoze (guanozin difosfat-fukoza) na akceptorski supstrat. Akceptorski supstrat može biti drugi šećer, kao što je transfer fukoze u jezgro GlcNAc (N-acetilglukozamin) šećera kao u slučaju N-vezane glikozilacije, ili na protein, kao u slučaju O-vezane glikozilacije koju proizvodi O-fukoziltransferaza. Kod sisara postoje različite fukoziltransferaze, od kojih se velika većina nalazi u Golđijevom aparatu. Nedavno se pokazalo da se O-fukoziltransferaze lokalizuju na endoplazmatskom retikulumu (ER).