BioPerl

BioPerl es un software de código abierto diseñado a partir de la colaboración entre bioinformáticos, biólogos y científicos del área de la computación, ante la necesidad de analizar y resolver problemas de la bioinformática.^[1]​ BioPerl es un proyecto activo financiado por la Open Bioinformatics Foundation, basado en módulos de Perl con el fin de facilitar la administración y manipulación de información relacionada con ciencias de la vida .^[1]​ Tales módulos son interfaces de tipos de datos de secuencias, alineamientos (BLAST, Clustal), características y localizaciones génicas y bases de datos (GenBank), entre otras. Con el fin de aprovechar BioPerl, el usuario necesita una comprensión básica del lenguaje de programación Perl que incluya una comprensión del uso de referencias, módulos, objetos y métodos.

La primera versión estable fue lanzada el 11 de junio de 2002; la última estable (en términos de la API) es la 1.6.9, lanzada en abril de 2011. También hay lanzamientos periódicos producidos por desarrolladores. La versión 1.6.0 es considerada la más estable (en términos de errores) y la versión de BioPerl se recomienda para el uso diario, se basa en Nightly Builds, también estable.

BioPerl ha desempeñado un papel integral en el Proyecto Genoma Humano.^[2]​

1. ↑ ^{a b} Stajich, Jason E. (2002). «The Bioperl Toolkit: Perl Modules for the Life Sciences». Genome Research. PMID 12368254. doi:10.1101/gr.361602. Consultado el 4 de diciembre de 2015. 
2. ↑ Lincoln D. Stein (1996). «How Perl saved the Human Genome Project». The Perl Journal 1 (2). Archivado desde el original el 2 de febrero de 2007.