Metaloprotease (bahasa Inggris: metalloprotease, metallopeptidase, metalloproteinase, metallocarboxypeptidase) merupakan salah satu jenis enzim golongan hidrolase yang mampu memotong ikatan peptida dengan bantuan ion logam bivalen sebagai aktivatornya.[1]
Metaloprotease terbagi menjadi dua klasifikasi yaitu:
Secara keseluruhan, terdapat 14 jenis enzim yang tergolong dalam kelas enzim metaloprotease dan kebanyakan diantaranya diaktivasi oleh ion Zn.[2] Ion logam lainnya yang dapat digunakan sebagai aktivator adalah mangan (Mn), kobalt (Co), nikel (Ni), dan tembaga (Cu).[1] Ion-ion logam tersebut akan terikat kuat membentuk suatu kompleks enzim.[1] Beberapa asam amino menjadi perantara ikatan ini, antara lain histamin, aspartat, glutamat, dan lisin.[1] Enzim-enzim ini dapat ditemukan pada banyak mikroorganisme, seperti Bacillus thermoproteolyticus, Vibrio alginolyticus, Thermus aquaticus, Bacillus anthractis, dan Escherichia coli.[1] Beberapa jenis fungi juga mampu menghasilkan enzim metaloprotease, seperti Aspergillus niger dan Saccharomyces cerevisiae.[3]