Holobionteak unitate ekologikoak osatzen dituzten espezie desberdinak elkartuz sortutako entitateak dira.
Terminoa, Lynn Margulisek "Symbiogenesis eta Symbioticism" aldizkarian sortutakoa, antzinako grezieratik dator: ὅλος (HOLOS, "guztiak" esan nahi du, eta βιὅς ("organismo" "izaki bizidun" esan nahi du).[1] Makroorganismo[2] (animalia edo landare) eta bere mikrobiota osatzen duten mikroorganismo sinbiotikoen arteko lotura aipatzeko erabiltzen da. Maiz hologenoma terminoarekin lotzen da. Genoma terminoarekin izan dezakeen analogiaz erabiltzen da hologenoma termino hori ostalariaren material genetikoa eta bere mikrobiota osatzen duten mikroorganismo guztiak izendatzeko.